Vissa referenser kan man inte importera till EndNote. Då får man lägga till dem manuellt, det vill säga fylla i den bibliografiska informationen själv. Det kan till exempel röra sig om referenser till:
För att lägga till en referens manuellt i EndNote, klicka på References > New Reference. Välj i listan Reference Type vilken typ av publikation/källa referensen gäller. Fyll i de fält som är relevanta för den aktuella publikationstypen och som behövs för den referensstil du ska använda (t.ex. APA 7 eller annan). Klicka på Save när du är färdig.